Ботаник, популяризатор науки, зачинатель российского природоохранного движения, один из основателей этико-эстетического подхода в заповедном деле и охране дикой природы.
Член-корреспондент (c 1887), ординарный академик ИАН (1902), Российской академии наук (1917), АН СССР (1925). Вице-президент РАН (7 октября 1917 г. - 31 мая 1919 г.).
Директор Ботанического музея АН. Член Байкальской комиссии АН (1916).
Брат Александра Парфеньевича Бородина, инженера путей сообщения, одного из основоположников русского паровозостроения.
